Das DIBt ist in fünf Fachabteilungen gegliedert.
Ingenieurstechnisch und wissenschaftlich breit aufgestellt sind die drei technischen Abteilungen des DIBt, die die Schwerpunkte Konstruktiver Ingenieurbau, Gesundheits- und Umweltschutz sowie Bauphysik und Technische Gebäudeausrüstung abdecken. Hauptaufgaben in diesen Abteilungen sind die Zulassung und Bewertung von Bauprodukten und Bauarten, die Erarbeitung und Begleitung von technischen Regeln, sowie weitere Aufgaben mit bautechnischem Schwerpunkt.
Die Präsidialabteilung bündelt die Kompetenzen des DIBt in den Bereichen Bauaufsichts- und Bauproduktenrecht. Zudem sind hier horizontale Koordinationsaufgaben angesiedelt.
In der Abteilung Zentrale Angelegenheiten stehen Haushalt und Beschaffung, Personal, IT und Digitalisierung, Serviceleistungen für das Haus sowie Öffentlichkeitsarbeit und internationale Beziehungen im Mittelpunkt. Geleitet wird das Institut von Präsident Gerhard Breitschaft, unterstützt durch die Verwaltungsleiterin Dr. Patricia Döring und Vizepräsident Dr.-Ing. Karsten Kathage. Die grundsätzlichen Angelegenheiten und Richtlinien für das DIBt entscheidet der Verwaltungsrat des Instituts, in dem die Länder und der Bund vertreten sind.